Создана детальная карта UTR-последовательностей нематоды C. elegans

Крупное исследование, в котором использовался многогранный подход, дало ряд важных результатов в области нетранслируемых областей (UTRs). Это важнейшие части генов, которые играют существенную роль в их регуляции экспрессии после транскрипции.

Исследователи извлекли и тщательно проанализировали данные UTR из 11533 общедоступных наборов данных, соответствующих полному транскриптому нематод Caenorhabditis elegans за 2009-2023 годы.

Кроме того, они использовали высокопроизводительные методы клонирования для идентификации и валидации редких вариантов UTR и включили вручную отобранные последовательности UTR из предыдущих исследований.

В результате они разработали обширный ресурс под названием "elegans UTRome v3", который охватывает 97,4% экспериментально подтвержденных генов, кодирующих белки у C. elegans. Границы UTR-последовательностей были уточнены для 23489 вариантов генов, что представляет собой значительный прогресс в нашем понимании этой области генетики.

Большое внимание было уделено выявлению и характеристике элементов последовательности, участвующих в процессинге зрелых пре-мРНК, а также прогнозированию мишеней для микроРНК. Это исследование предоставляет ценную информацию о формировании, функционировании и регуляции нетранслируемых участков у эукариотических организмов.

Источник: Nucleic Acids Research.

0 комментариев