Science Advances: покадровая сегментация данных выявляет динамику состояния клеток in vivo

Исследователи определили экспрессию генов и состояние движения клеток, используя данные секвенирования одноклеточной РНК и данные покадрового отслеживания клеток хвостового бутона рыбки данио in vivo, сообщает Science Advances.

Ученые выполнили параллельную идентификацию этих состояний, используя методы уменьшения размеров и алгоритм обнаружения точек изменения. Оба типа состояний клеток были количественно отображены на эмбрионах, и они использовали состояния движения клеток для изучения динамики переходов биологических состояний с течением времени.

Усредненная по времени картина состояний движения клеток воспроизводима среди эмбрионов. Однако отдельные эмбрионы демонстрируют временные отклонения от среднего значения по времени, формируя асимметрию влево-вправо при коллективном движении клеток.

Таким образом, воспроизводимый паттерн состояний клеток и двусторонняя симметрия возникают в результате усреднения по времени. Кроме того, коллективное поведение клеток может быть источником асимметрии, а не буфером против шумного поведения отдельных клеток.