Ученые разработали молекулу для нарушения механизма заражения коронавирусом SARS-CoV-2

Молекула нацелена на менее изученный в исследованиях COVID-19 фермент PLpro, который помогает коронавирусу размножаться и препятствует иммунному ответу организма хозяина. Молекула, называемая ковалентным ингибитором, образует прочную химическую связь со своим белком-мишенью и тем самым повышает эффективность противовирусного лечения.

По словам Паркса, исследование, подробно описанное в журнале Nature Communications, позволило превратить ранее выявленный нековалентный ингибитор PLpro в ковалентный ингибитор с более высокой эффективностью. Используя клетки млекопитающих, команда показала, что молекула ингибитора ограничивает репликацию оригинального штамма вируса SARS-CoV-2, а также вариантов Delta и Omicron.

Ученые ORNL использовали вычислительное моделирование, чтобы предсказать, будут ли их разработки эффективно связываться с ферментом и нарушать его функцию. Затем они синтезировали молекулы и протестировали их в ORNL и партнерской компании Progenra для подтверждения своих прогнозов.

Белок был выращен и очищен с использованием возможностей Центра структурной молекулярной биологии на источнике спаллирующих нейтронов, или SNS, в ORNL. Яркие рентгеновские лучи, генерируемые Стэнфордским источником синхротронного излучения, или SSRL, в Национальной ускорительной лаборатории SLAC, были использованы для картирования молекулы и изучения процесса связывания на атомном уровне, что подтвердило результаты моделирования. SNS и SSRL являются пользовательскими установками Управления по науке Министерства энергетики.