Благодаря огромному технологическому прогрессу генетический материал живых существ сегодня можно секвенировать со стремительной скоростью. Сравнение геномов, как близкородственных, так и совершенно разных видов, позволяет обнаружить особенно интересные находки.

Однако сравнение геномных данных сопряжено с непростыми техническими проблемами. Чтобы упростить процесс анализа, группа ученых разработала новый метод и представила его в журнале Science, сообщает Phys.org.

При сравнении геномов различных организмов научные знания приобретаются в ходе двухэтапного процесса. Сначала необходимо локализовать отдельные гены в геноме соответствующего вида. Затем, для сравнения, второй шаг - определить, какие гены в двух организмах соответствуют друг другу. Оба этапа являются технически сложными и затрудняют получение новой информации из сравниваемых геномных данных.

Новый вычислительный метод TOGA (Tool to infer Orthologs from Genome Alignments) упрощает такой анализ и решает обе задачи вместе. Для определения ортологичных генов исследователи используют тот факт, что участки в генах, кодирующие белки, обычно более похожи друг на друга, чем кодирующие участки других генов. Метод TOGA распространяет этот принцип сходства на весь геномный контекст гена.

Исследование показало, что ортологичные гены в геномах других млекопитающих могут быть точно локализованы только с помощью известных генов человека или мыши. Аналогичным образом, известные гены курицы могут быть использованы для определения местонахождения ортологичных генов в геномах других птиц.