Новый статистический метод улучшает геномный анализ

Новый статистический метод обеспечивает более эффективный способ выявления биологически значимых изменений в геномных данных, которые охватывают множество условий, таких как типы клеток или тканей.

Исследования всего генома дают огромное количество данных, начиная от миллионов отдельных последовательностей ДНК и заканчивая информацией о том, где и сколько из тысяч генов экспрессируются. Из-за большого объема и сложности данных сравнение различных биологических условий или исследований, проводимых отдельными лабораториями, может быть статистически сложным.

"Существующие методы требуют больших вычислительных затрат или дают результаты, которые трудно интерпретировать биологически. Мы разработали метод под названием CLIMB, который улучшает существующие методы, эффективен с точки зрения вычислений и дает биологически интерпретируемые результаты. Мы тестируем этот метод на трех типах геномных данных, собранных из гемопоэтических клеток, относящихся к стволовым клеткам крови", - сказал Куньхуа Ли, профессор статистики в Пенсильванском университете.

Исследователи описывают метод CLIMB в журнале Nature Communications.

0 комментариев